Etude de la diversité génétique de quelques palmiers dattier mâles et essai d’identification d’empreintes génétiques de dokkars les plus proches de «Deglet-Nour » moyennant les marqueurs microsatellites

Abstract

L’étude de la diversité génétique du palmier dattier aussi bien mâles que femelles est une étape indispensable pour la mise en place des programmes de sélections et d’amélioration. Pour ce travail, en plus de l’étude de la diversité génétique des dokkars, notre étude vise à identifier les pollinisateurs génétiquement les plus proches des génotypes femelles appartenant aux importants cultivars commerciaux, principalement ‘Deglet-Nour’ et ‘Ghars’. Dix types de dokkars du palmier dattier nommés selon leurs ressemblances extérieures à des cultivars femelles, un pollinisateur inconnu et deux importants cultivars femelles «Deglet-Nour» et «Ghars» de la région des Zibans ont été caractérisés moyennant des descripteurs morphologiques et des microsatellites. Au total 67 descripteurs de l’IPGRI, du protocole MOCAF de l’AMAP-CIRAD et quelques autres descripteurs de traits quantitatifs proposés par nous-même ont été utilisés pour la caractérisation phénotypique, dont 12 descripteurs pour la partie végétative et 21 pour la partie de reproduction ce sont avérés très discriminants. La caractérisation moléculaire, moyennant 25 microsatellites, a montré une grande variabilité génétique. Le nombre moyen d'allèles amplifiés (135) est élevé avec une hétérozygotie moyenne des loci SSRs (Ho =0.688, He =0.436). Sur les 25 SSR utilisés, la combinaison de deux paires d'amorces ont efficacement séparé six accessions. Nos résultats suggèrent que le marqueur SSR spécifique (MPDCIR35) qui caractérise à la fois les individus mâles et femelles de "Deglet-Nour", pourrait être utilisé comme marqueur potentiel pour sélectionner, à un stade précoce de la plante, le pollinisateur le plus proche de l'individu femelle de ce cultivar. De plus, MPdCIR25 représente un marqueur potentiel pour identifier les accessions de dokkar "Ghars". La caractérisation morphologique et moléculaire suggèrent que les accessions «Deglet-Nour» semblent avoir une base génétique homogène par rapport aux autres accessions, cela pourrait être utilisé comme moyen de certification et de contrôle des produits algériens «Deglet-Nour». La majorité des accessions du dokkar Deglet-Nour semblent être les plus proches du cultivar femelle Deglet-Nour, sur le plan morphologique de la partie végétative et moléculaire, par rapport aux autres accessions étudiées (dokkar/cultivar). Tandis que, les individus mâles et femelles «Ghars» n'étaient pas phénotypiquement proches et avaient des profils génétiques différents et ont été classés séparément. Des cas d’homonymies entre quelques accessions étudiées ont été révélés. Le niveau de similarité obtenu par le dendrogramme UPGMA était compris entre 0.176 à 1, révélant des groupements d’accessions selon l’origine. L'incorporation d'un nombre élevé d'accessions, avec d’autres régions géographiques, et d'autres marqueurs SSRs dans les études génétiques élargira la portée des futures études sur les pollinisateurs du palmier dattier